藥學系于2001年開始招收全日制統招藥學專業專科生，2009年開始招收全日制藥學專業本科生，擁有藥學本科、藥物制劑本科學士學位授予權和藥學專業專升本招生資格，現有在校生900余人，其中本科生497人。學校非常重視藥學專業的建設與發展，專業建設水平迅速提升，取得了一系列國家級、省級成果。2011年，藥學本科專業被山東省教育廳批準為山東省高等學校特色專業，山東省高校生物醫學工程技術重點實驗室批準建設，《藥理學》課程被評為省級精品課程；2012年，藥學本科專業獲批為教育部地方高校第一批專業綜合改革試點專業，也是我校唯一一個國家級“本科教學工程”項目。2014年，我校被評為山東省民辦本科高等教育特色名校立項建設單位，其中藥學本科、藥物制劑本科專業是兩個重點建設專業。
藥學系共有專兼職教師45人，教授10人，副教授11人，碩士以上學位占74%，師資隊伍職稱結構、學歷結構、年齡結構合理。專業教師中“雙師素質”教師占78 %，其中山東省高等學校教學管理先進個人1名，山東省科協國家級科技思想庫決策咨詢專家1名，淄博市高校系統優秀教師2名，校級教學名師1名。近三年，藥學系充分發揮中青年教師的科研優勢，重視教科研結合，確立了以科研促進教學、科研為教學服務的研究思路，取得良好效果。先后主持省級教科研立項課題13項，主持校級教科研課題20余項，發表論文50余篇，其中SCI收錄25篇，榮獲山東省藥學會科學技術獎三等獎2項，淄博市科學技術獎二等獎1項。主編教材4部，副主編教材6部。
藥學系始終秉承“以服務為宗旨、以就業為導向、以崗位需求為標準”的原則，加強專業建設，提高教學質量，通過畢業設計、挑戰杯科技創新比賽、專業技能大賽等加強學生的實踐動手能力培養。現已有169名本科生進入實驗室開展畢業設計，參與教師課題研究，學生實踐動手能力明顯提高。
藥學系下設系辦公室、學生管理科、藥學教研室、藥理教研室、化學教研室及藥學實驗中心。實驗中心設有藥劑學實驗室、藥物分析實驗室、藥物化學實驗室、藥理學實驗室等專業實驗室，擁有應用藥學教科研創新平臺，總面積1000余平米，擁有高效液相色譜儀、氣相色譜儀、紅外色譜儀、激光粒度分析儀、電化學工作站等價值300余萬元的先進儀器設備，完全滿足校內實踐教學需求。2013年，學校與淄博奈琦爾生物科技有限公司組織優勢資源成立“海藻生物質醫用材料及制品應用研發工程中心”，建成近
經過十余年的建設發展，藥學系辦學水平社會聲譽度逐年提升，就業率連續四年在97%以上。2014屆畢業生中，已有50%學生通過“實習+就業”模式與企業達成了就業意向。畢業生憑過硬的理論知識、技能、良好的工作表現贏得了用人單位的一致好評！
